为了更好地开展科技计划项目管理工作，以项目管理理论为基础，利用现在计算机网络资源，建立以全流程管理的科技计划项目管理系统，实现对项目申报、评审、审批、查询、监督、合同管理、绩效管理、验收等综合管理的控制和信息资源的共享。通过业务系统为申报单位提供服务、为领导决策提供参考、为项目实施提供依据、为科技项目管理提供操作平台、提高项目评审的透明度、提升工作效率、规范管理。
科技计划项目管理主要要解决三个问题：科技项目的流程管理、信用管理和科技项目绩效评估。
（1）科技项目流程管理主要目的是规范日常项目管理行为，实行数据共享，协同办公，提高管理工作的透明度和办事效率。按照项目生存周期理论分析主要分类三个阶段：前期的申报立项、中期的项目监管和后期的验收（评审）。整个科技项目管理的重点工作是实施好这三个过程。
（2）合同管理包括合同填报、主管部门合同审核、处室合同审查和合同复审、合同签订打印等一系列管理工作。
（3）科技项目绩效评估是指科技项目完成以后所取得的经济和社会效益进行综合评估，建立综合评估指标，分别对工业、农业和社会发展等项目进行绩效评估，在大量项目数据积累的基础上，进行综合分析，为以后科技项目的支持方向提供决策支持。
